Канунников проходил фигурантом по уголовному делу о халатности (ч. 1 ст. 293 УК РФ). Однако в ходе рассмотрения материалов дела суд не нашел состава преступления.
Канунников покинул пост в мае 2024 года. Причиной стало достижение пенсионного возраста. Его преемником стал Владимир Захаров — бывший вице-мэр Бердска.